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济南庄盟生物技术有限公司提供样品测序服务

  • 发布日期:2012-08-27 11:24
  • 有效期至:长期有效
  • 招商区域:山东济南市
  • 浏览次数373
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详细说明
 测序流程

一、基本测序过程:

测序接收的样品主要一般有四类:菌、质粒、已纯化PCR和PCR原液。实验室收到样品后,首先对客户填写的定单进行确认和补充。(客户姓名、单位地址、邮箱、电话、样品编号、引物编号、反应数)。然后根据不同的样品类型对样品进行分类编号。

1. 测序前处理:

◆菌样:将当天收取的菌样进行接种培养,过夜培养后用试剂盒进行质粒提取。将提出的质粒跑琼脂糖胶鉴定质粒浓度,达到三博公司规定浓度的质粒交下一组实验,未达到规定浓度的质粒和未摇出菌的样品,作好记录后重新摇菌并提取质粒,对于两次未能提出质粒或不能摇出菌的样品,不再重复实验,E-MAIL给客户,建议客户重新挑取新的克隆样品后测序。

◆PCR原液:将PCR原液上样于纯化胶后电泳检测,对浓度较高的样品进行切胶用胶回收试剂盒回收,去除PCR引物、酶和其他杂质。然后电泳检测样品浓度,达到规定浓度的PCR样品交下一组实验。浓度不高的样品将停止实验,(注:电泳后有多条带和有弥散带的样品也将停止实验,因为这样的样品通常不能得到好的测序结果)。

◆质粒和PCR已纯化样品:将质粒和PCR已纯化样品直接电泳检测浓度,对于不能达到规定浓度的样品将停止实验。达到规定浓度的样品交下一组实验。

2. 测序反应:

将处理好的DNA模板经鉴定确定浓度,做PCR测序反应,PCR反应结束后经过一系列的纯化过程将酶、荧光染料、引物和其他离子去除。

3. 上ABI 3730测序仪做毛细管电泳。

4. 测序结果分析:

测序仪将自动分析电泳样品的DNA序列。之后我们的分析人员对测序结果再次进行分析校对,数据分析完毕马上将结果通过E-MAIL发送给相应的客户。如果客户的测序结果有问题,我们将对结果进行分析并提出解决建议。

5. 客服:

如果客户需要查询测序结果或咨询测序相关问题,可以通过电子邮件或电话与我们联系,我们设有专业的客服人员为您提供服务。

二、测序报告的说明

1.提供报告的形式:

◆测序报告通常为电子版的彩色图谱和的序列图,以Email形式发送。

2.查看测序报告方法:

◆先阅读Chromas及补丁使用方法文档。

◆通过Chromas软件打开图谱文件进行查看及编辑工作。Chromas软件可进行图谱文件的打开、修改、序列的反向互补操作、导出文本序列等。如果发生软件只能打开图谱却不能进行其他任何操作的,是因为软件60天试用期已过。

◆序列保存为纯文本文件,可在Notpad或Word中将其打开。

◆所测序列是与客户提供的引物方向一致的DNA链序列,测序结果是从引物序列之后开始的,并不包括引物序列。

◆通常从测序引物20~30bp以后到大约800bp之间的序列是可靠的,其后的序列因为存在错读,只能作为参考。序列以峰型图为准。较长的片段需要双向进行测序或设计合成中间引物才能测通。

3.以下情况下只发E-mail不提供测序报告:

◆没有反应信号;

◆信号极其杂乱(PCR产物测序结果除外);

4.特殊结构计费:

序列由于有严重的二级结构(Poly N 结构,GC结构,重复结构,二级回文结构等)导致出现信号中断、衰减、套峰的情况,均按正常反应计费。

5.样品保存:

凡送到我公司测序的样品与引物,我们都保存二个月,在这个期限内,客户可以对样品进行加测,或者是将样品返回,超过这个期限的样品我们都会将其销毁。我们就不一一通知客户,请客户注意。

济南庄盟生物技术有限公司

联系人:周洋

电话:053188039191

邮件:jnzmsw@163.com

手机:15069153393

地址:济南市历城区山大北路54号金泰

 
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