生物帮生物通

采购帮忙热线
020-87540820
020-38498013
 
发布信息当前位置: 首页 » 产品 » 技术服务 » 微生物学服务 »

微生物群落结构及多样性分析技术

点击图片查看原图
品牌: 微生物群落结构及多样性分析技术
型号: 微生物多样性分析
规格: 微生物多样性分析
单价: 面议
发货期限: 自买家付款之日起 3 天内发货
所在地: 北京
有效期至: 长期有效
浏览次数: 27
询价
公司基本资料信息
 
 
产品详细说明

细菌16S rDNA 是细菌染色体上编码16S rRNA 的DNA 序列,存在于所有细菌染色体基因中,其序列能够显示细菌间不同分类等级水平上的特异性,适用于细菌亲缘关系的研究,并可作为测量细菌进化和亲缘关系的良好工具,同时可以利用可变区序列的差异对不同菌属、菌种的细菌进行分类鉴定。

真菌18S rDNA/ITS序列是真菌染色体上能够用于进行亲缘关系研究,测量真菌进化和亲缘关系的工具,同样可以利用基因可变区序列的差异对不同菌属、菌种真菌进行分类鉴定。

通过构建细菌16S rDNA 序列、真菌18S/ITS序列分析可以分析某一特定环境中微生物群落结构和细菌多样性,对于研究微生物与环境的关系、环境治理和微生物资源利用有着重要的理论和现实意义。

 

★服务内容

克隆文库分析:

PCR 方法扩增特定环境样品中细菌16S rDNA或真菌18S rDNA/ITS,使用TA 克隆方法构建克隆文库,挑选阳性克隆测定基因序列,并与GenBank 中已知序列进行同源性比较,获得特定环境中的微生物群落结构和多样性信息。

T-RFLP末端限制性酶切片段分析:

PCR 方法扩增特定环境样品中细菌16S rDNA或真菌18S rDNA/ITS,采用T-RFLP 限制性内切酶对扩增产物进行限制性酶切,利用DNA分析仪分析末端限制性酶切片段,获得末端限制性酶切片段长度,峰高及面积等信息,PAT数据库分析比对获得特定环境中的微生物群落结构及多样性信息。

DGGE 变性梯度凝胶电泳分析:

PCR 方法扩增特定环境样品中细菌16S rDNA或真菌18S rDNA/ITS,通过变性梯度凝胶电泳分析环境样品中微生物菌群落结构;将凝胶电泳条带回收后克隆测序,确定微生物种属关系,获得特定样品中的微生物多样性信息。

高通量测序MiSeq分析:

采用第二代高通量测序平台MiSeq,对核糖体RNA高变区域,比如16S rDNA/18S rDNA/ITS等序列,或功能基因,比如细菌和古菌的氨氧化酶基因进行测序,揭示环境样品中众多不同类型微生物种属关系,获得特定样本中的微生物多样性信息。

MiSeq测序仪具有样品制备迅速、测序时间快(8小时内)、测序总 长长的特点,能在短时间内获得高质量测序结果。同时,Miseq测序仪整 合了簇生成、SBS测序和完整的数据分析,而不再需要配置辅助性硬件。 每次反应可以产生6G以上的数据,测序读长可达到2×250bp,使每个样品 的测序量达到普通测序的几百倍,而单条序列的测序费用远低于普通测 序。基于以上特点,Miseq逐步被广泛应用于环境微生物多样性研究。

根据客户提供的样本(环境样本、基因组DNA、PCR产物)及需要检测的微生物多样性类型(细菌、古菌、真 菌、功能基因),利用Miseq测序平台对目的片段进行高通量测序,并对测序结果进行生物信息学的分析。

检测样品:

样品种类:土壤、海洋、污泥、动物肠道、水样等; 样品形式:环境样品、基因组DNA、PCR产物; 检测种类:细菌、真菌、古菌、功能基因等。

样品要求:

1. 样品类型: DNA或PCR产物

2. 样 品 量:≥500ng或≥100ng

3. 样品浓度: ≥10ng/μL或≥5ng/μL

4. 样品纯度:OD260/280=1.8-2.0,无降解 5. 样品切忌反复冻融,冰袋或干冰运输。

无标题 

 

 

生物帮站内所有产品仅限于生命科学实验室科学研究使用,不得用于临床诊断及药物治疗。

快速询价
 
更多»本企业其它产品

[ 产品搜索 ]  [ 加入收藏 ]  [ 告诉好友 ]  [ 打印本文 ]  [ 关闭窗口 ]

 
网站首页 | 企业资料认证流程 | 广告服务 | 关于我们 | 联系方式 | 使用协议 | 网站地图 | 排名推广 | 广告服务 | 网站留言 | RSS订阅 | 粤ICP备11050685号-8
Processed in 0.082 second(s), 8 queries, Memory 1.59 M